目的 分析儿童医院重症手足口病病原谱及其变迁规律，了解此类患者临床特征。方法 收集2012年1月至2021年12月辽宁省大连市妇女儿童医疗中心（集团）儿童院区665例住院重症手足口病患儿的临床资料行回顾性分析。统计重症手足口病一般发生状况、不同年份发生率、月份分布、病原谱［肠道病毒通用型（EV）、肠道病毒A组71型（EV71）、柯萨奇病毒A组16型（CoxV-A16）、CoxV-A10和CoxV-A6等］、病原体变迁情况及临床特征。结果 重症手足口病男性重症率高于女性［1.0%（409/40 918）比0.9%（256/30 075）］，差异有统计学意义（P<0.05）。重症手足口病发病有明显的季节性，每年7—8月为发病高峰季节。2012—2021年665例重症手足口病患儿粪便标本检出病原体种类有EV、EV71、CoxV-A16、CoxV-A10、CoxV-A6和其他病原体；其中EV共194例、占比29.2%，EV71共130例、占比19.6%。不同时间流行优势病原体不同，2012、2013和2014年为EV71和EV，2015年为EV和CoxV-A16，2016—2018年为EV和CoxV-A6，2019年为EV、CoxV-A16和CoxV-A6，2020年为EV、CoxV-A10和CoxV-A6，2021年为EV和CoxV-A10。2012—2013年重症患儿主要表现为神经系统症状，2014—2021年多以循环系统症状为主；神经系统症状主要表现为呕吐、头痛、肢体抖动、嗜睡和抽搐。循环系统症状主要表现为心率加快、呼吸加快、发绀和血压异常。结论 儿童医院手足口病病原体复杂、呈多样性，优势病原体可发生变迁，未知亚型占比也有变化。重症病例临床可出现重要器官及多系统损害。